一般情况下，新生儿苯丙酮尿症可能与遗传、氨基酸代谢障碍、基因突变等因素有关，需要积极治疗。具体分析如下：
1.遗传：苯丙酮尿症是一种常染色体隐性遗传病，一般表现为智力低下、精神异常等症状，如果家族中患有苯丙酮尿症，那么后代中患有苯丙酮尿症的可能性会比较高。
2.氨基酸代谢障碍：当新生儿机体由于缺少酶元素导致氨基酸出现代谢障碍的情况，从而使得苯丙氨酸不能正常转化，可能就会造成苯丙酮尿症。
3.基因突变：当新生儿基因发生突变，造成相关酶的活性缺陷，可能就会导致苯丙氨酸发生异常累积，从而引起苯丙酮尿症。
除以上常见原因外，还可能是其他情况导致的，如染色体异常，新生儿出现苯丙酮尿症时，家长可以通过饮食治疗，可以给新生儿选择低苯丙氨酸配方奶，能够帮助改善症状。
