马兰头根就是马兰头草的根。马兰头根直立，有时略带红色。市面上，马兰头有两种品种，一种是有红色根茎、颜色偏深绿色的，另一种是白色根茎、颜色淡绿。红色根茎的马兰头是野生的，靠手工一棵棵挖的，而白色根茎的马兰头是大棚种殖的，大棚种植的马兰头看上去卖相好，但味道淡，吃口差一点。
我国有春天采食马兰头嫩叶嫩茎的习惯，夏、秋季则采收全草，洗净，鲜用或晒干做药。马兰头根一般鲜用或晒干做药。
中医认为马兰头根性味辛凉、微寒，有清热解毒、凉血止血、利湿消肿之功效。主治咽喉肿痛、痛疖疗疮、黄疸、水肿、痢疾、淋浊等症。如有吐血，衄血，齿衄及皮下出血性紫斑病等正阿黄，用 鲜红梗马兰根或全草适量，洗净捣烂绞汁，以温水冲服，或大量全草煮汁服。此外，农户种植马兰头，一般也是采用分根繁殖的方法。每年入冬前，挖掘马兰头根，选择地势高燥、排灌方便、土质好的田块,将马兰头根切段平铺在沟底，覆土后削平踏实。
