我们都知道食用油主要成分是甘油三脂，而转基因大豆所转移的基因的作用就是让植物产生更多EPSPS酶，和植物油脂的成分没有关系，在加工豆油的过程中转基因成分大部分已经被去掉了，不过，人们对食用转基因大豆油的担忧在于是否有些微量混杂在油脂中，进而被人摄入，从而影响人的安全，它的危害可能体现在以下几个方面：
1、影响人类的基因。转基因大豆中所转的基因片断混入人体，从而对人体本身的基因造成影响。
2、转基因大豆的EPSPS合成酶比普通的大豆多，而过多的EPSPS合成酶进入人体，可能会影响人类的健康。
3、所转基因可能会有人类所不知的功能，与植物合成一些对人类健康有害的物质，并随大豆油进入人体造成影响。
4、大豆可能会被施以过多的草甘膦除草剂，这些除草剂可能随大豆油进入人体，影响人体的健康。
5、营养被破坏。科学家们认为外来基因会以一种人们目前还不甚了解的方式破坏食物中的营养成分。
6、对抗生素产生抵抗。当科学家把一个外来基因加入到植物或细菌中去，这个基因会与别的基因连接在一起。人们在服用了这种改良食物后，食物会在人体内将抗药性基因传给致病的细菌，使人体产生抗药性。
从营养安全的角度讲，目前还没有发现转基因食品不利于人体健康的证据，也没有出现因此引发的食品安全纠纷，所以这些危害会否成真还需要时间验证。如果消费者担心自己的身体健康，可以选择“非转基因食品”。
