三个月宝宝消化不良能否自愈，需结合消化不良的原因、病情严重程度及个人体质等因素进行分析，轻症一般可以自愈。
若孩子偶尔出现消化不良，精神状况良好，可能是因腹部受凉或喂养不当所致。三个月的宝宝胃肠道功能发育尚未完善，且消化酶活力较低，易引发菌群紊乱，肠道蠕动也会出现异常，不注意饮食或腹部受凉很易引起消化不良。只要及时调整饮食结构，避免腹部持续受凉，症状多半都能自行恢复。
少数患儿消化不良的症状较为严重，伴有明显腹泻、腹胀或腹痛等现象，且持续时间较长，已经影响正常进食及精神状态，甚至引起严重的并发症。这种情况多半都无法自愈，需遵医嘱应用药物治疗，避免病情进一步加重。
