宝宝偶尔做一次脑CT检查，对身体健康的影响不会太大，多次做脑CT检查对身体健康的危害相对较大。
从理论上说，宝宝做脑CT是有一定影响的。因为CT检查有一定的电离辐射，反复为患儿做脑CT检查，还未做好防护措施，很可能会损伤甲状腺、生殖器官等。免疫力低下的患儿反复做脑CT检查，伤害会更大。如可能使体内细胞发生癌变，出现脑瘤等恶性颈，还可能损伤白细胞，导致白细胞计数降低，免疫功能受损，感染细菌、病毒的几率增加。月龄较小的患儿做脑CT时哭闹，无法配合检查，可能需要应用镇静剂。是药三分毒，小儿体质差，应用镇静剂的副作用可能会更大，对身体健康不利。
但与疾病对身体伤害相比，做脑CT检测带来的伤害利大于弊。偶尔进行一次脑CT检查，在做脑CT检查时还能用铅衣覆盖甲状腺、生殖器等部位，对宝宝的身体影响可以忽略不计。
