输卵管结核的治疗过程中，常规的化验只能作用作参考，可以证明有结核感染，存在活动的病灶，但无法明确病灶的部位。确诊还需要做x线，子宫输卵管碘油造影，腹腔镜检查。
输卵管结核在必要时应该作消化道、泌尿系统的x线检查，这样做的目的是为了找到原发病灶。如果在腹部平片中发现了盆腔中有可疑的孤立钙化点，这也就是提示了有结核病灶的存在。
进行子宫输卵管碘油造影，可看到输卵管当中的狭窄部分，这些狭窄部分形态类似串珠状，但有时也是细小而僵直的状态，可以看到输卵管中的钙化灶，如果子宫内膜或是盆腔累及，它也会发生改变。子宫输卵管碘油造影，对于生殖器结核个诊断有重要意义。
输卵管结核确诊通过腹腔镜检查可以更加直接的查到盆腔的病变。比如输卵管有没有粟粒状结节附着于浆膜面儿上，输卵管管是否和周围的其他组织有黏黏的现象，还可以直接看到输卵管或是卵巢有没有增厚的表现。操作时可以直接在病变的部位取出微量组织进行活检，但应慎重操作，避免使肠管受到损伤，如果仍然无法确诊，则应进行剖腹探查。
