奶瓶消毒完成后，应将留在瓶身内的水彻底倒净，之后倒扣沥干，并以消毒过的奶瓶夹，将消毒过的奶瓶、奶嘴、奶瓶盖等，放在专门的收纳盒里，以利于之后取出使用。
收纳盒应随时保持干燥、清洁放在通风、干净处放，并盖上纱布或盖子。此外，若于消毒24小时后仍旧没有使用奶瓶，就需重新进行一次消毒工作，以免细菌滋生。此外，用来夹奶瓶的夹子也要定期消毒，同时不可再做其他用途。现今有许多消毒锅都兼有烘干、直接收纳的功能，相对地可节省家长的辛劳。
