中药灌肠疗法治疗结肠炎，可以使药物直接到达病变部位，同时能起到局部清洗清洁的作用，达到止泻消炎、解抽解痛、改善局部血液循环和新陈代谢，增强肠道免疫功能，促进溃疡愈合的目的。具体药物和操作如下:
1、菊花30g、白术15g、防风10g、甘草10g、白芷8g、米壳15g。便血重时加入防风炭、云南白药适量，溃疡广的人加入雷公藤6g。用药水煎后，用双层纱布过滤渣，回锅浓缩到60~80ml，用药液保留灌肠，每晚1次，连续7~10天为1个疗程。
2、黄芪、白术、丹参、白芍各20g、黄连、黄芩苷、侧柏叶、防风各15g、金银花、连翘、白及、面料各10g，每药煎3次，每药煎250ml，3次共750ml，其中早、午饭前各服250ml，其馀250ml药液在晚上睡前用于灌肠。
3、苦参30g、地榆15g、槐花15g。水煎浓缩到100~250ml，将珍珠层粉6g溶解在药液中，保留灌肠。腹痛明显无药，莪术行气活血，散瘀止痛大便次数增多，结肠水肿明显者，加入薏仁利水消肿，健脾止泻，清热排脓。
4、生蒲黄10g、鹤草、败酱草、乳香各15g，无药6g，烧龙骨10g先煎，生蚝10g先煎，红石脂10g先煎。将药煎至200毫升药液，每晚睡前灌肠，15天为一个疗程。
5、用壁虎研究结束后合白，煎成粘性汤保留灌肠，每3天1次，5次为1个疗程。另外，将壁虎、白色和各半研究粉放入胶囊中，每次2~3粒，灌肠间歇服用，1个疗程结束后服用胶囊2周，治疗期间可停用其他西药。中药灌肠应每晚睡前进行，灌肠前排出大便，药液温度宜为36℃~39℃。
