许多患者对前列腺炎认识不足，经常混淆前列腺炎和泌尿系统的其他疾病，延误治疗。
慢性前列腺炎根据病史、症状、直肠诊断、前列腺液检查等一般诊断不难，但对症状复杂、体征不典型的人应与以下疾病进行鉴别。
1、前列腺脓肿:急性细菌性前列腺炎并发症多发生在50~60岁，半数患者急性尿滞、尿频、排尿困难、直肠不适、尿道流脓、附睾炎。直肠诊断前列腺疾病侧增大，触摸柔软，有波动感。偶尔前列腺脓肿可以自然向尿道破裂，也可以向直肠破裂，被误认为是直肠周围的脓肿。
2、前列腺疼痛:这些患者持续尿频、尿痛、排尿困难，会阴、下腹、腰骶等部位疼痛不适，久坐、骑自行车后恶化。直肠诊断两侧肛提肌压痛明显，前列腺接触正常，无压痛。过去，这种疾病被称为梨状肌肛提肌症候群，前列腺液镜检查正常，无细菌培养生长。
3、前列腺结核:症状与慢性前列腺炎相似，但常有泌尿系结核或其他部位结核病灶的病史，直肠诊断前列腺呈不规则结节状，睾丸肿大硬化，输精管呈串珠状硬结，前列腺结核杆菌直接涂层或PCR检测结核菌。
4、前列腺结石:指前列腺泡内和腺管内发生的结石。前列腺位置置炎症、前列腺积液、腺管狭窄、代谢紊乱等因素有关。无机盐如草酸钙、磷酸钙、磷酸镁等沉积在前列腺泡沫内的淀粉样本体，上皮细胞和炎性渗出物形成结石，患者可以表现出慢性前列腺炎的各种症状，但直肠诊断表明前列腺有结石摩擦感，骨盆x线在耻骨联合区侧有阳性结石影，超声波检查表明前列腺结石部有强光带，有声影。
5、耻骨骨炎:临床上常出现慢性前列腺炎症状，但肛门诊断和前列腺液检查正常。主要特征是耻骨联合处有明显的压痛，骨盆x线片显示耻骨联合间隙扩大>10毫米，双侧耻骨上支水平差>2毫米，耻骨联合边缘不规则，出现侵蚀和反应性骨硬化。
6、前列腺癌:末期可出现尿频、尿痛、排尿困难等症状，但患者经常出现消瘦、疲劳、贫血、食欲不振等明显全身症状，直肠诊断前列腺有硬块，表面高低不平，血清前列腺特异抗原和前列腺酸性磷酸酶增高。前列腺穿刺活检可发现癌细胞，B超显示腺体增大，边界回声不整齐或有缺陷，内部光点不均匀，癌肿部位有亮点或光团。CT检查显示前列腺形态不对称，肿瘤浸入包膜外，精囊和膀胱后壁的组织间隙消失。CT可以确定前列腺癌的浸润程度。
7、急性肾盂肾炎:急性肾盂肾炎多见于女性，男性极少见，急性肾盂肾炎引起的腰痛多为单侧肾区，敲击痛明显。急性前列腺炎引起的腰痛多为腰骶部中央，肾区无磕伤。急性前列腺炎前列腺液中可大量脓细胞，急性肾盂肾炎主要是尿性质的变化。
