非洲锥虫病对患者具有非常恶劣的伤害，轻则引起疼痛、恶心呕吐等症，重则使患者昏迷甚至死亡，所以做好预防非常重要。由于此病主要来源于寄生原虫，所以从源头上隔绝是非常有效的方法，平时应给家里做好卫生清洁，注意杀虫，外出时要做好防病虫措施。
非洲锥虫病临床上共分为三个时期，第一为侵入皮肤后引起不同程度的硬块和结节，并演变成锥虫性下疳，下疳发生于约三分之一的病人且出现的部位常为皮肤外露被虫蝇(tsetsefly)叮咬处，持续约3星期。第二为血液淋巴时期，此时会有周期性发烧及寄生虫血症等症状，包括倦怠、后颈部淋巴节肿、关节疼痛、头痛及躯干红疹等情形发生，常见心肌炎，而因溶血及肝损伤之故也常见黄疸之出现。一旦侵入了脑部后，则会进入第三期脑膜脑炎时期，此时会有头痛、失眠、动作失调及行为障碍等情形发生，其他症状包括全身乏力、胃口剧烈下降、身体消瘦等，严重者甚至会并发神智下降、昏迷甚至死亡。下面介绍一下锥虫性“下疳”的预防方法：
1、流行地区居家环境及家畜喷洒杀虫剂。
2、避免前往有大量采采蝇的地区；旅客如须前往，应尽量穿着长袖及长裤以覆盖身体外露的部份，避免穿着会吸引采采蝇的蓝色衣物。
3、家中加装纱窗、纱门。
4、使用及睡在蚊帐内。
5、加强卫生教育宣导如何避免病媒蚊叮咬的重要性。
6、加强洗手。
7、病人住院期间，医疗工作人员应采标准防护措施，加挂蚊帐，碰触血液、体液前后应用消毒剂洗手。
8、清除中间宿主采采蝇的栖身地，如河边灌木丛。
9、做好检疫，找出感染源加以扑灭。
