调剂肠道菌群的益生菌很多，枯草芽孢杆菌、双歧杆菌、嗜酸乳杆菌等益生菌效果较好。
枯草芽孢杆菌中含有枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素、短杆菌肽等活性物质，可消耗肠道中的游离氧，制造肠道低氧，促使厌氧菌生长，并帮助合成蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶等活性酶，帮助消化，提高肠胃功能。
双歧杆菌是生理性有益菌，可抑制有害菌在肠道中生长，还能合成维生素，促使矿物质吸收，产生丙酸、醋酸、丁酸、乳酸等有益物质，净化肠道环境，刺激肠道蠕动，有缓解便秘、对抗肿瘤等作用。
嗜酸乳杆菌存在胃部与小肠中，会释放乳酸、乙酸等活性物质，可有效对抗肠道中的有害菌，改善肠道微生态环境，调节肠道菌群平衡，还能促进肠道对食物的消化。但要注意自己不可盲目补充益生菌，以免使肠道产生依赖性。
