(1)包茎：正常男子的阴茎皮肤较薄，近阴茎头部的皮肤向内反折成双层，覆于阴茎上，称为包皮。若包皮口狭小，紧包阴茎头不能将包皮向上翻转而显露阴茎头时称为包茎。小儿出生时包皮与阴茎头之间存在粘连称为先天性包茎。还有一种后天性包茎是继发于阴茎头包皮炎，包皮口形成瘢痕性挛缩所致。
(2)隐匿阴茎：是指耻骨部脂肪过多，而附着于阴茎体的阴茎皮肤不足，以致阴茎隐匿于耻骨部的皮肤中。本病可能同时合并阴茎头型尿道上裂，此时隔着阴茎皮肤可触及阴茎背侧的尿道沟。
(3)阴茎阴囊转位：又称阴茎前阴囊。是阴囊长到了阴茎前面，因并发其他严重畸形多不能存活，故临床罕见。完全性阴囊位移少见，部分阴茎阴囊位移者常伴尿道下裂。
(4)阴茎扭转：从阴茎的解剖结构可知，阴茎由背侧的两个阴茎海绵体和腹侧正中的一个尿道海绵体组成，在发育过程中，若阴茎海绵体发育不对称时，就发生了阴茎扭转，其扭转的程度由阴茎海绵体发育不平衡程度决定。
(5)蹦床状阴茎:阴囊从薄皮肤延续到阴茎腹侧，阴茎阴囊融合。
(6)重复阴茎:包括分叉阴茎在内，完全重复阴茎和另一个异位阴茎三种情况，分叉阴茎发生率高。重复阴茎可以仅限于阴茎头或全阴茎体。
(7)无阴茎:患者天生不生阴茎，尿道开在会阴、肛门附近甚至直肠内。本病非常罕见，约200万新生男孩中有一例。
(8)大阴茎：顾名思义，与同年龄的人比较阴茎过大，称大阴茎。一般来说，正常成人阴茎7~10厘米，勃起时会加倍。本病多发生于青春期早熟、先天性痴呆症、侏儒症、垂体功能亢进和肾上腺功能亢进者。
(9)小阴茎:正常男性新生儿阴茎长度平均为3。5~7厘米，小阴茎不足1厘米，进入青春期，男性小阴茎呈儿童型。
(10)先天性阴茎弯曲:阴茎腹侧尿道海绵体短，阴茎弯曲腹侧。
