1、诊断:肛裂、瘘口、痔脱垂、肛周炎症、血迹等。指示患者排便动作，会阴下降者可以看到盆底以肛门为中心明显向下突出的肛门收缩，盆底支配神经严重损伤者，收缩能力减弱或消失。
2、肛门指检：了解肛门括约功能，明确病变部位和性质，可提供重要依据。指检肛门括约肌紧张者多见于内括约肌失弛缓症，肛门紧张而兼疼痛者可能合并有肛裂；触及条柱状硬便及直肠明显膨大者，多见于直肠性便秘；便前检查直肠呈空虚状态，或触及粒状粪便者多见于结肠性便秘。指检时直肠前方，耻骨联合以上直肠向会阴方向突入者提示直肠前突性便秘。
3、直肠诊断:如果肛门管张力提高时，肛门管附近可能有刺激性病变。肛门管不能通过手指时，肛门管具有器质性狭窄，常见于低位肿瘤、肛门管手术后或不当硬化剂注射后的伤痕形成。一些患者可以触摸直肠壶腹部的硬粪块。直肠积存了大量粪便，没有便意的话，直肠就没有力量了。直肠前突患者在排便动作时，可在括约肌上、耻骨联合下方扪及袋状薄弱区。直肠内套叠患者，直肠壁松弛，诊断时直肠内有粘膜堆积的感觉，偶然也可以接触叠叠的肠壁。
4、粪便检查:直肠型便秘粪便常呈硬柱状，常有直肠粘膜继发性炎症，或排便时损伤肛门，粪便外观可见粘液或血迹；大便状如羊箭，干硬成粒多见于痉挛型便秘；结肠易激综合征粪便多为羊粪状，或大便腐烂交替，大便带粘液，粘液涂层，一般正常或少量白细胞，便秘型直肠溃疡性结肠炎，大便多为红白细胞和粘液，但必须注意直肠肿瘤的鉴别。
5、x线检查:消化道狭窄、息肉、肿瘤、扩张、肠道休息室等引起便秘的疾病，还可以明确肠道运动功能。钡剂灌肠，尤其是近年来采用的结肠低张双重造影，可能对发现便秘的病因有所帮助。
(1)粪便造影。粪便造影可以显示造影剂的图像和利用荧光技术观察排便过程、速度。该检查目前广泛应用于临床。排便造影对怀疑有以下原因的便秘患者具有重要价值:骨盆底肌协同失调(耻骨直肠肌矛盾收缩)和直肠前突(如有阴道直肠壁手术史)等。
(2)钡饮食检查。可以知道钡剂通过胃肠道的时间、小肠和结肠的功能状态。肠易激综合征常表现为结肠袋加深 ，痉挛性便秘肠腔常紧张变细呈锯齿状或铅管状；弛缓性便秘或乙状结肠冗长者，大肠变长，扩张或下垂；出口梗阻性便秘，直肠明显扩大。对疑有结肠梗阻者，口服钡剂灌肠因可加重梗阻，应视为禁忌，为了明确结肠器质性病变的性质、部位与范围，宜用钡剂灌肠。
6、内镜检查:直肠镜、乙状结肠镜、纤维(电子)结肠镜等。除了直视或屏幕清楚地知道肛肠病变的部位、性质、范围等外，还可以通过活体组织进行病理检查明确诊断。
(1)直肠镜检查。简单实用，可直视观察直肠是否发炎、糜烂、溃疡、息肉、肿瘤、肛裂、痔疮、狭窄、直肠粘膜是否松弛、下垂、肠套叠等。
(2)肠镜检查。针对结肠冗长、巨结肠、溃疡性结肠炎、克隆棣病、结肠憩室、肠结核、肿瘤、肠梗阻、放射性肠炎、结肠易激综合征等引起的便秘，具有重要的诊断和鉴别诊断价值。
7、肛门镜检查：内痔、低位直肠肿块均可窥及。当直肠粘膜有充知水种、糜烂而难以用一般炎症解释时，应考虑直肠内套叠的可能性。如果有来源不明的血迹，特别是旧的血迹，必须注意上方肿瘤的可能性。
