溃疡性肠炎的最初表现有很多形式。血性腹泻是最常见的早期症状。其他症状依次有腹痛、便血、体重减轻、内急后重、呕吐等。偶尔主要表现为关节炎、虹膜睫状体炎、肝功能障碍和皮肤病变。
发热是一个相对不常见的迹象，在大多数患者中，本病表现为慢性、低恶性的少数患者(约15%)中呈急性、灾害性暴发过程。这些病人表现为血性粪便，可多达30次/天，高热、腹痛。
体征与病期和临床表现有直接关系，患者体重减轻和脸色苍白，病期腹部检查时肠部疼痛较多。可能有急腹症征象伴发热和肠鸣音减少，在急性发作或暴发型病例尤为明显。中毒性巨大结肠有腹胀、发热、急腹症的迹象。
由于腹泻频繁，肛周皮肤可以受伤、剥落。还可发生肛周炎症如肛裂或肛瘘，虽然后者在Crohn病中更为常见。直肠指检感疼痛。皮肤、粘膜、舌头、关节和眼睛的检查非常重要。
