慢性肠炎多是因急性肠炎迁延不愈导致的，慢性肠炎的形成多与下列因素有关：
1、慢性肠道细菌感染性疾病：如慢性细菌性痢疾、溃疡型肠结核、沙门氏菌感染、肠道菌群失调。
2、肠寄生虫病：如慢性阿米巴痢疾、慢性血吸虫病、肠鞭毛虫病、结肠小袋纤毛虫病、肠道蠕虫病等。
3、非细菌性炎症:克氏病、慢性非特异性溃疡性肠炎、结肠休息室炎、结肠息肉并发结肠炎等。
4、肠肿瘤：如结肠癌、直肠癌、小肠恶性淋巴瘤。
5、胃原性慢性腹泻:慢性萎缩性胃炎、胃癌末期、胃空肠吻合术后。
6、胰原性慢性腹泻：如慢性胰腺炎、胰腺癌晚期。
7、肝、胆道疾病引起慢性腹泻。
8、内分泌、代谢障碍疾病:甲亢、慢性肾上腺皮质功能减退、垂体前叶功能减退、糖尿病。
9、尿毒症、糙皮病、放射性肠炎、硬皮病。
10、痉挛性结肠（过敏性结肠炎）、神经精神性腹泻。
