小儿自闭症可能是因受遗传因素、脑结构和功能异常、环境污染的影响所致；具体能否治好，与病因有关。
与遗传因素的关系非常密切，遗传的高度可以达到80%-90%，如果父母或者至亲的人有自闭症后代比正常人发病率要高。这种情况引起的自闭症，通常无法彻底治愈。
主要是存在小脑发育不良、脑干萎缩、杏仁核缩小，或是因为发生了胼胝缩小、海马缩小、侧扣带回缩、早期脑体积增大。如是先天性因素所致，自闭症很难治好，而后天性因素引起的脑发育不良，通过改善，大多能治好，自闭症也能逐渐康复。
可能是因长期接触重金属和空气污染的环境，可能会产生中毒性反应，不及时改良生活的环境，易导致脑部神经受到刺激后间接性的诱发自闭症。如果能及时改良环境，自闭症会逐渐好转，慢慢恢复正常。
