怀孕期间能做DNA鉴定，可以根据怀孕时间的不同，相应选择胚胎绒毛DNA鉴定、羊水穿刺DNA鉴定、无创DNA鉴定等。
在怀孕早期想要做胎儿DNA亲子鉴定，可在怀孕7周左右抽取胚胎的绒毛进行基因鉴定，这是进行亲子鉴定最早的方法，但这种方法并不能保证100%的准确，因胎儿绒毛膜样本是从母体中提取，操作不当可能会有母亲的DNA成分。孕早期胎儿着床不稳定，进行DNA鉴定有导致流产的风险。
一般在怀孕16周左右，可抽取羊水进行鉴定。因怀孕16周时胎儿比较稳定，抽取2-4毫升的羊水不会对胎儿造成损伤，安全系数较高，通过羊水鉴定DNA的精准性也非常高。
怀孕12-22周时，还可抽取孕妇的静脉血作为检测标本，提取胎儿游离的DNA信息，与男性DNA进行比对，也可进行DNA亲子鉴定，这种鉴定方法属于无创DNA鉴定，对孕妇和胎儿都没有伤害。
