临床上大体将癫痫的病因分为特发性、症状性和隐源性类。特发性癫痫除可能与遗传因素有关外，没有其他可寻的病因；症状性癫痫具有已知或可疑的中枢神经系统病变；隐源性癫痫推测为症状性，但以目前的认识水平尚未发现病因。
癫痫发病的遗传因素指对癫痫的遗传易感性。大量研究证明，癫痫和遗传因素有关。遗传可以影响细胞膜离子通道的功能，降低惊厥阈值，引起神经元放电。双胎癫痫符合率的研究及家系脑电图的研究都提示癫痫性素质为常染色体显性遗传，且在5～15岁之间外显率最高。已证实或推测与遗传因素有密切关系的癫痫综合征包括儿童及少年失神性癫痫、少年肌阵挛性癫痫、儿童良性癫痫伴中央颞区棘波、常染色体显性遗传夜间额叶癫痫等特发性全身或局部性癫痫，其中有些综合征的基因已定位。在很多情况下，特发性和遗传性癫痫作为同义语来使用。但在某些情况下两者并不相同，如症状性癫痫中有许多遗传性疾病，例如结节性硬化、神经纤维瘤病等，癫痫只是这些遗传性疾病造成的脑损伤引起的症状。换句话说，此时遗传的是这些疾病本身而不是癫痫。
