体温计的测量位置也是有一定的讲究的，不同的测量位置有不同的注意事项。
口腔温度的采集是借由病患将温度计正确且安全的放置到口腔的能力。也就是排除了小孩或是无力抵抗咳嗽、虚弱的人或是会呕吐的人。（这在反应快速的电子式温度计来说比较没有问题，但在水银式温度计中就是一个重要的课题，因为水银式温度计需要长的时间来反应温度）其他应该注意的地方是，当病患在使用口腔式温度计前如果有饮用热饮或是冰饮，那就必须考量其他的温度测量方法。
直肠：在直肠温度的量测时，特别是由另一人来量测时，应该要使用润滑剂来帮助。虽然直肠温度最为准确，但是要考量这样的行为在某些国家或是文化中是令人难为情的。另外如果置入温度计的方式不正确则会让病人感到不舒服甚至疼痛。婴儿通常都使用直肠温度量测，然而还是要借由护士来操作比较妥当。
耳内或是前额：另外有利用红外线量测技术量测耳内鼓膜的耳内温度计以及量测前额的前额温度计。
腋下：使用前先将体温计的水银汞柱甩到35℃以下。将体温计水银端放在腋下最顶端（即腋窝深处），用上臂将体温计夹紧，以免脱位或掉落；测量5—10分钟；取出体温计，读取温度数据后，用卫生纸擦拭体温计，以便下次或他人使用。
读数方法：一手拿住体温计尾部，即远离水银柱的一端，使眼与体温计保持同一水平，然后慢慢地转动体温计，从正面看到很粗的水银柱时就可读出相应的温度值。读数时注意千万不要用手碰体温计的水银端，这样会影响水银柱而造成测量不准。
注意事项：
1、腋下如有汗液，需擦干再量。
2、若测量时间未到，松开腋下，则需重新测量，时间应重新计算。
3、在测量体温前凡影响实际体温的因素（如饮开水或冷饮等）均应避免，喝热饮、剧烈运动、情绪激动及洗澡需待30分钟后再测量。
4、玻璃体温计最高温度值是42℃，因此在保管或清洁时温度不可超过42℃，不可将体温计放入热水中清洗或用于测量水及其他物体的温度。
特别注意事项：玻璃体温计易破碎，存在水银（汞）污染的可能。
