结肠息肉一般手术后出现的并发症主要有灼伤、出血、肠穿孔等，并有结肠内易燃气体在电灼时死亡的报告。预防主要是熟练掌握操作技术，严格遵守操作规范，肠道准备尽量不用甘露醇。
而对于有家族性结肠息肉的并发症可能有：
1、可出现肠套叠、肠套叠依据临床发病缓急和梗阻程度，分为急性、亚急性和慢性3型。
2、急性肠套叠多发生在宝宝身上，以持续性、完全性急性肠梗阻者为特点；亚急性肠套叠，抽搐发生时间轻短，呈不完全性肠梗阻，多见于儿童。
3、慢性肠套叠在慢性反复发作中，容易成人。根据病理变化，临床症状不同。肠梗阻、大出血、失血性休克等并发症也可发生，伴有全消化道息肉时无法根治。
此外，结肠息肉还会导致贫血、肠狭窄、中毒性肠扩张、肠穿孔、结肠肿瘤。
