男性不育的主要原因是生精障碍、输精障碍、免疫因素等。
1、精液异常如无精子或精子数过少，活力减弱，形态异常。影响精子的原因是①先天性发育异常:先天性睾丸发育不完全不能生育精子，双侧睾丸引起曲细管萎缩等妨碍精子的发生。②全身原因:慢性消耗性疾病，如长期营养不良、慢性中毒(吸烟、酗酒等)、精神过度紧张，可能影响精子的发生。③局部因素:腮腺炎合并睾丸炎导致睾丸萎缩，睾丸结核破坏睾丸组织，精索静脉曲张影响精子质量等。
2、精子运输受精巢和输精管炎症、结核堵塞输精管，阻碍精子通过。例如阳痿、早泄、射精功能紊乱、逆行射精、尿道下裂等不能使精子进入女性阴道。
3、免疫因素精子对自己有抗原性，但免疫屏障不会对自己产生免疫反应:男性生殖道免疫屏障被破坏时，精子、精浆在体内对抗自己精子的抗体会产生男性不育，注射的精子自己凝聚，不能通过宫颈粘液。
4、内分泌功能障碍男性内分泌受下丘脑垂体睾丸轴功能障碍。例如性腺功能低、性腺功能亢进、雄激素不敏感综合征、高泌乳素血症、甲减、甲亢等都会影响精子的产生而导致不孕。
5、性功能异常不能使精子进入女性阴道，如外生殖器发育不良、阳痿等性交困难。
