生殖器疱疹好发于性活跃期男女，好发于生殖器及会阴部，少数也会累及到肛周、直肠，原发性和复发性生殖器疱疹常见，且有其各自典型的临床表现。除此之外，还有以下特殊类型的生殖器疱疹：
1、亚临床型生殖器疱疹
临床上大约有50%的1型单纯疱疹病毒感染者和70%～80%的2型单纯疱疹病毒感染者缺乏典型的临床表现，被称为亚临床型生殖器疱疹，是生殖器疱疹最主要的传染源。其不典型皮损可表现为生殖器部位的微小裂隙、溃疡等，常常被忽略。
2、妊娠期生殖器疱疹
妊娠期生殖器疱疹皮损特点无特异性，但容易引起胎儿宫内发育迟缓、流产、早产甚至死产，产道分娩可引起胎儿感染，因此，应该注意选择生产方式。
3、HIV感染合并生殖器疱疹
此类患者皮损较重，表现为广泛、多发、慢性持续性溃疡及坏死，疼痛剧烈，病程较长，复发更频繁，对常规阿昔洛韦治疗效果不好，常需进行病毒抑制治疗。
