患者喝藿香正气水不能有效缓解痛经，而且不建议在月经期喝。部分藿香正气水中含有一定酒精成分，由于酒精有活血化瘀作用，因此部分患者误以为，喝藿香正气水可以帮助缓解痛经，酒精虽然可以活血化瘀，但并不能有效缓解痛经，同时由于酒精刺激性，反而有可能对月经造成不利影响，例如导致月经量增大、经期延长、月经淋漓不尽等。
藿香正气水中由于含有藿香、苍术、法夏等寒凉类药物，患者在月经期喝还可能导致寒邪，造成痛经、月经排出不畅等不良状况。藿香正气水有温中化湿和解表散寒作用，因此平时可以用于外感风寒、内伤湿滞的症状，例如患者中暑、夏季感冒，平时有胃肠型感冒，存在胸闷、呕吐等症状，也可以通过藿香正气水帮助缓解。
