在人类乳头瘤病毒感染的早期或尖锐湿疣边缘，看上去仍是正常的皮肤和黏膜，颜色正常，并不高于黏膜表面；但从组织学上进行观察，已有人类乳头瘤病毒的病理改变，这种情况就叫做尖锐湿疣的亚临床感染。
通常情况下，尖锐湿疣亚临床感染常分三种类型：
①微小无蒂疣，主要见于阴茎、大阴唇外侧的皮肤干燥部位，常为单个或若干个，1～3毫米直径大小，常见病毒为HPV-16 型，若皮损太小，常被忽视，应该用放大镜观察。
②微小乳头状隆起，可见于女阴前庭及阴道内。一般多发，呈乳头状或绒毛状隆起，或融合成颗粒状外观。病变泛发或局限，与HPV-6型感染有关。
③外观正常的环状皮损，可见于阴茎，女性外阴、阴道和子宫颈。早期用醋酸白试验才能看到，在放大镜下更明显。可能是HPV-16型感染所致。尖锐湿疣亚临床感染的存在是尖锐湿疣复发率高的一个重要原因。同时，这些病人患处肉眼所见不到的疣体，可数年无症状而成为带病毒者，通过性接触更易感染他人，因而应该引起足够重视。
