规范操作，做普通胃镜不会有明显疼痛感，但患者相对较痛苦。
胃镜检查时，会将直径约一厘米的细长管子，从口腔中深入食道、胃部、十二指肠，医生在另一端观察上消化道各个部位健康状况。普通胃镜不使用麻醉剂，患者在做胃镜检查时感觉特别直观。从口腔进入咽喉时，被检查者会感觉异物穿入咽喉，可能有恶心想吐的感觉。当胃镜从咽喉部进入贲门时，会感觉异物进入食道，有撕肉感，患者比较痛苦。在做胃镜时，需要通过导管向胃内充气，暴露胃壁，患者需持续张嘴，不停流口水，也会感觉比较痛苦。但这些操作疼痛感并不是特别明显。
如医生经验不足，操作不当，可能会损伤食管、胃粘膜，引起疼痛感。
如心理压力大或对疼痛比较敏感时，可以选择无痛胃镜，做胃镜前应用麻药减轻痛苦。
